Counting of bioparticles in microscope images

Nicolas Bonneel, Juan Carlos Garcia Hernandez
for our 5th year project at INSA for "Génie Biochimique et Alimentaire" department, 2005-2006
Teacher : Philippe Schmitz

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When a flow is applied onto a surface with bioparticles on it, theses bioparticles dettach progressively. The aim of the project is to count the number of particles present in different photos taken at different stages of the flow intensity with a microscope. There are some criterions which particles should respect to be taken into account (distance from each others etc..), so we must not count all particles. The counting is done with a image analysis software : "Analysis".
Once we know that, we can draw the graph of the number of particles depending on the flow intensity, so that particles parameters can be computed.
Keywords : bioparticles, image analysis, particles counting

Lorsqu'un courant est appliqué sur une surface avec des bio-particules dessus, ces bio-particules se détachent progressivement. Le but de ce projet et de compter le nombre de particules présentes sur différentes photos prises à différentes étapes de l'intensité du courant, au microscope. Il y a plusieurs critères que les particules doivent respecter pour être prises en compte (distance entre elles etc..), donc on ne doit pas toutes les compter. Le comptage est opéré par un logiciel de traitement d'image : "Analysis".
Une fois comptés, nous pouvons dessiner le graph du nombre de particules en fonction de l'intensité du courant, afin que les paramètres des particules puissent être calculées.
Mots clefs : bioparticules, traitement d'image, comptage de particules.